Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zc3h18Q0P678 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zc3h18Q0P678 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zc3h18Q0P678 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms