Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Lrriq1Q0P5X1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Lrriq1Q0P5X1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lrriq1Q0P5X1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms