Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Vps8Q0P5W1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Vps8Q0P5W1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vps8Q0P5W1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms