Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubxn2bQ0KL01 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2bQ0KL01 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms