Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ttc21bQ0HA38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ttc21bQ0HA38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ttc21bQ0HA38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ttc21bQ0HA38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms