Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnnm1Q0GA42 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnnm1Q0GA42 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms