Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc7a1Q09143 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc7a1Q09143 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc7a1Q09143 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms