Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnma1Q08460 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnma1Q08460 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms