Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tgm3Q08189 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tgm3Q08189 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tgm3Q08189 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms