Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CbfbQ08024 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CbfbQ08024 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms