Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
F13bQ07968 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F13bQ07968 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms