Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AmbpQ07456 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AmbpQ07456 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms