Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdx4Q07424 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdx4Q07424 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdx4Q07424 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms