Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nfe2Q07279 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nfe2Q07279 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nfe2Q07279 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms