Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gdf3Q07104 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdf3Q07104 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdf3Q07104 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms