Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CluQ06890 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CluQ06890 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CluQ06890 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CluQ06890 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CluQ06890 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CluQ06890 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CluQ06890 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CluQ06890 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CluQ06890 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CluQ06890 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms