Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp2Q06649 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp2Q06649 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp2Q06649 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms