Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Thbs3Q05895 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thbs3Q05895 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms