Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hspg2Q05793 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hspg2Q05793 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms