Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox8Q04886 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox8Q04886 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox8Q04886 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox8Q04886 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox8Q04886 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox8Q04886 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox8Q04886 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox8Q04886 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox8Q04886 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox8Q04886 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox8Q04886 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms