Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top1Q04750 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top1Q04750 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1Q04750 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top1Q04750 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top1Q04750 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top1Q04750 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Top1Q04750 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top1Q04750 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top1Q04750 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top1Q04750 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top1Q04750 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top1Q04750 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top1Q04750 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms