Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk16Q04735 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk16Q04735 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk16Q04735 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms