Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nf1Q04690 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nf1Q04690 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms