Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kcnd1Q03719 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnd1Q03719 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnd1Q03719 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms