Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnb1Q03717 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnb1Q03717 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms