Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tff2Q03404 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tff2Q03404 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tff2Q03404 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms