Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccl7Q03366 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccl7Q03366 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl7Q03366 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms