Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Msx2Q03358 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Msx2Q03358 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms