Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Runx1Q03347 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Runx1Q03347 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Runx1Q03347 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms