Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgfr4Q03142 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fgfr4Q03142 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fgfr4Q03142 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fgfr4Q03142 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms