Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkczQ02956 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkczQ02956 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkczQ02956 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkczQ02956 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms