Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mmp11Q02853 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mmp11Q02853 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms