Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GscQ02591 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GscQ02591 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GscQ02591 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GscQ02591 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GscQ02591 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GscQ02591 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GscQ02591 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GscQ02591 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GscQ02591 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GscQ02591 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GscQ02591 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GscQ02591 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GscQ02591 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GscQ02591 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GscQ02591 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GscQ02591 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GscQ02591 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GscQ02591 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GscQ02591 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GscQ02591 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GscQ02591 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GscQ02591 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GscQ02591 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GscQ02591 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GscQ02591 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GscQ02591 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GscQ02591 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GscQ02591 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GscQ02591 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GscQ02591 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GscQ02591 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms