Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp39Q02525 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp39Q02525 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms