Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd1Q01822 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd1Q01822 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms