Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nme2Q01768 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nme2Q01768 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms