Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mc1rQ01727 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mc1rQ01727 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mc1rQ01727 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms