Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbp1Q01514 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gbp1Q01514 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gbp1Q01514 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms