Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Top2aQ01320 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Top2aQ01320 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Top2aQ01320 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Top2aQ01320 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms