Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EgfrQ01279 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EgfrQ01279 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EgfrQ01279 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms