Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col1a2Q01149 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Col1a2Q01149 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col1a2Q01149 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms