Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grin2cQ01098 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2cQ01098 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2cQ01098 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms