Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pde1bQ01065 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pde1bQ01065 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pde1bQ01065 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms