Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde4dQ01063 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde4dQ01063 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde4dQ01063 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde4dQ01063 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde4dQ01063 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde4dQ01063 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms