Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrcdQ00LT2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrcdQ00LT2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms