Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp1Q00915 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp1Q00915 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbp1Q00915 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms