Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfaQ00731 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VegfaQ00731 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms