Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
F8a1Q00558 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
F8a1Q00558 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms