Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HmmrQ00547 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmmrQ00547 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmmrQ00547 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms