Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pax8Q00288 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax8Q00288 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax8Q00288 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms